INVAHUB - Centrální databáze nepůvodních škodlivých organizmů

19. 06. 2025 RNDr. Jiří Skuhrovec, Ph.D.; Národní centrum zemědělského a potravinářského výzkumu v.v.i., Praha-Ruzyně Škůdci Zobrazeno 652x

Nepůvodní škodlivé organizmy (ŠO) představují rostoucí hrozbu pro přírodu, zemědělství i lesní hospodářství. Jejich šíření je často nenápadné, avšak dopady mohou být závažné - od ekologické nerovnováhy po hospodářské ztráty. Včasná identifikace a účinné sledování výskytu těchto organizmů je proto klíčové pro ochranu biodiverzity i veřejného zájmu. Na základě potřeby lepší koordinace a sdílení dat mezi institucemi vznikla centrální databáze invahub.cz, která propojuje informace z několika odborných i občanských platforem.

Princip sdílení dat

Základním pilířem webové databáze invahub.cz je spolupráce a sdílení dat mezi různými institucemi a iniciativami, které se zabývají výskytem nepůvodních škodlivých organizmů (ŠO). Tento přístup vychází ze studie: Spolupráce výzkumných organizací k možnostem zapojení do procesu získávání informací o rozšíření nepůvodních škodlivých organizmů, která byla realizována v roce 2022. Na základě této analýzy byli ke spolupráci přizváni zástupci 4 významných českých databází: dvě hlavní odborné instituce ÚKZÚZ a AOPK ČR, občanskovědní platforma najdije.cz a komunitní projekt biolib.cz. Společným cílem bylo vytvoření centrální databáze, která umožní efektivní sdílení a vizualizaci georeferencovaných dat. Zásadním krokem bylo zpřístupnění sdílených údajů prostřednictvím webové platformy invahub.cz, kde jsou data přehledně zobrazena v podobě interaktivních map. Tato vizualizace usnadňuje sledování výskytu jednotlivých nepůvodních druhů napříč územím ČR i za jejími hranicemi.

Centrální databáze je průběžně denně aktualizována na základě dat poskytovaných zapojenými institucemi i veřejnými aktivitami. Přenos dat z invahub.cz do klíčových národních systémů - Rostli­nolékařského portálu ÚKZÚZ a NDOP (AOPK ČR), probíhá automatizovaně na denní bázi, vždy podle potřeby a pro konkrétní druhy. Jakýkoli nový záznam karanténního druhu, který není součástí zdrojových dat ÚKZÚZ, je navíc okamžitě hlášen prostřednictvím e-mailového upozornění na adresu karantena@ukzuz.cz.

Seznam sledovaných organizmů

Sledované organizmy v databázi invahub.cz jsou rozděleny do čtyř hlavních kategorií: bezobratlí živočichové, obratlovci, rostliny a choroby (včetně virů, bakterií a hub). Základ centrálního seznamu tvoří druhy uvedené na Rostlinolékařském portálu ÚKZÚZ, kde jsou klasifikovány jako karanténní, invazní nebo obecně nepůvodní škodlivé organizmy. Tento výchozí seznam byl dále rozšířen o druhy zařazené mezi druhy významné pro EU, a také o několik nepůvodních druhů bezobratlých živočichů (např. kutilka asijská nebo hlemýždík kropenatý), které jsou pravidelně monitorovány v rámci občanskovědní platformy najdije.cz.

Na žádost ÚKZÚZ došlo v roce 2024 k rozšíření seznamu o druhy uvedené na EPPO Alert Listu. Do databáze byly zároveň doplněny i druhy, které se na tomto seznamu v minulosti nacházely, ale již na něm aktuálně nefigurují. Paralelně s tím byly v průběhu roku na platformě najdije.cz zahájeny nové pátrací akce, např. sledování vroubenky americké nebo nepůvodních druhů síťnatek, ploštic rodu Corythucha. Všechny tyto druhy byly již zařazeny i do centrální databáze invahub.cz.

Významným posunem bylo zařazení nových druhů na základě evropského Horizon Scanning workshopu, který se konal na konci roku 2024 v Bruselu pod záštitou mezinárodní organizace IUCN. V rámci tohoto setkání vznikl seznam přibližně 170 potenciálně invazních druhů, které by v příštím desetiletí mohly představovat riziko pro biodiverzitu na území EU. Každý druh byl hodnocen podle pravděpodobnosti zavlečení, usídlení, šíření a dopadů na ekosystémy, přičemž výsledky byly získány pomocí standardizovaného skórovacího systému. Ačkoliv ofi­ciální publikace seznamu je plánována na polovinu roku 2025, výstupy z workshopu byly již zapracovány do centrální databáze invahub.cz jako důležitý podklad pro prediktivní monitoring a preventivní opatření.

Vizualizace dat

Každý záznam v centrální databázi invahub.cz obsahuje několik základních atributů. Součástí každého záznamu je jak unikátní interní identifikátor ID, tak i ZDROJ_ID, tedy označení z původní databáze, z níž daný záznam pochází. Vzhledem k tomu, že jednotlivé spolupracující databáze používají různé souřadnicové systémy, je v rámci invahub.cz vždy zachována informace o původním zdroji i použitém souřadnicovém systému. Pro účely tvorby map jsou všechna georeferencovaná data následně automaticky převedena do jednotného systému. Každá lokalita je zároveň přiřazena ke konkrétnímu katastru obce, kam podle svých souřadnic náleží. Data uložená v databázi lze rozdělit do dvou základních typů podle míry ověření: verifikovaná data (ověřená odborníkem) a neverifikovaná data (zatím bez odborného potvrzení). I neverifikovaná data však procházejí validací na úrovni zdrojových databází, kde jsou označena stupněm věrohodnosti.

Zpřístupnění a filtrování dat je umožněno prostřednictvím přehledných interaktivních tabulek, rozdělených do 4 hlavních kategorií: bezobratlí, obratlovci, rostliny a choroby. V rámci těchto tabulek lze data filtrovat podle taxonomické příslušnosti, časového období, stupně ověření nebo podle konkrétních lokalit a druhů (tab. 1). Výsledky lze snadno exportovat v různých formátech (např. XLS, CSV, PDF) nebo rovnou vytisknout. Databáze je aktualizována denně, čímž je zajištěna vysoká aktuálnost všech výstupů. Denní integrace probíhá napříč klíčovými zdroji - ÚKZÚZ, AOPK ČR, najdije.cz a biolib.cz, a garantuje, že vizualizace i tabulky odpovídají nejnovějším údajům.

Součástí vizualizačního systému je také možnost sledovat časovou dynamiku výskytu druhů pomocí aktualizovaných map. Data jsou rozdělena na recentní nálezy (za posledních pět let) a historické záznamy (mapa 1), což uživatelům umožňuje sledovat dlouhodobý vývoj a šíření invazních organizmů. U každého nálezu jsou zobrazovány podrobnosti včetně českého a latinského názvu druhu, konkrétní lokality, data nálezu a původu záznamu (mapa 2) v rámci projektu invahub.cz. V případech opakovaných nálezů na totožných GPS souřadnicích, což je běžné např. při pravidelných kontrolách prováděných ÚKZÚZ, se na mapě zobrazuje pouze nejaktuálnější záznam. Všechny předchozí nálezy však zůstávají v databázi plně dohledatelné, což zajišťuje úplnost a analytickou využitelnost historických dat.

Do budoucna se počítá s rozšířením vizualizačních nástrojů i o grafické analýzy, např. časové řady, mapy šíření nebo sezonní dynamiku, které umožní ještě hlubší porozumění šíření nepůvodních škodlivých organizmů na území ČR i v evropském kontextu.

Tab. 1: Zobrazení filtrace v tabulce bezobratlých s daty v projektu invahub.cz

Mapa 1: Aktualizovaná mapa bezobratlých s výběrem časového období

Mapa 2: Vizualizace mapy vybraného nálezu s detaily 

Aktuality

Využití principů občanské vědy (citizen science) je dosud v České republice limitované, a to zejména na monitoring invazních rostlin a vybraných obratlovců. V oblasti bezobratlých nebo chorob však tento přístup nebyl doposud systematicky aplikován. Zkušenosti z platformy najdije.cz, která se věnuje sledování nepůvodních a invazních bezobratlých živočichů, přinášejí cenné poznatky pro rozšíření této metody i na další skupiny organizmů. Zvlášť důležité je to pro vyhodnocení relevance dat získaných od široké veřejnosti.

V sekci Aktuality (obr. 1) na webu invahub.cz jsou publikovány novinky, jako například metodika pro výuku žáků 2. stupně ZŠ a nižších ročníků gymnázií nebo spuštění aktualizovaných map výskytu ŠO. Uživatelé mají možnost přihlásit se k odběru novinek a dostávat upozornění o zveřejnění nového obsahu e-mailem. Pro efektivní šíření informací a oslovení co nejširší veřejnosti je klíčová spolupráce s

odbornými komunitami a využití i jejich sociálních sítí. Takto lze cíleně oslovovat konkrétní skupiny uživatelů a zároveň zajišťovat pravidelnou komunikaci s dobrovolníky zapojenými do sběru dat. Forma sdílení informací je vždy přizpůsobena dané cílové skupině.

Pro zvýšení kvality dat od veřejnosti se připravují informační materiály, např. letáky popisující vzhled nepůvodního ŠO nebo škody, které způsobuje (např. požerky). Tyto materiály slouží nejen k identifikaci organizmů, ale i jako návod, jak správně zaznamenat pozorování. Propagační aktivity cílí zejména na školy a přírodovědně orientovanou veřejnost, přičemž formy komunikace se průběžně přizpůsobují podle zájmu jednotlivých skupin. První vizuální propagační materiály, např. vizitky, placky nebo magnetky, jsou již připraveny a jejich nabídka se bude postupně rozšiřovat. Paralelně s tím probíhá také průběžné vylepšování webových stránek, zejména z hlediska jejich přehlednosti a vizualizace dat.

Obr. 1: Zobrazení podstránky aktuality na webu invahub.cz

Budoucnost databáze

Centrální databázi invahub.cz je nutné dále rozvíjet, a to jak po technické, tak obsahové stránce. Prioritou je nastavení efektivního systému pro správu taxonomických změn a přidávání nových sledovaných druhů. Dále se plánuje integrace dalších datových zdrojů, přičemž výběr konkrétních partnerů bude probíhat postupně. Klíčová bude také prezentace databáze odborné veřejnosti, například na setkáních Invazní platformy, a navázání spolupráce se správci dalších specializovaných databází.

Databáze již nyní obsahuje data o výskytech nepůvodních ŠO mimo území ČR, například z platformy najdije.cz. Tato informace, i když zatím slouží spíše k doplnění kontextu, umožňuje lépe predikovat rizika příchodu invazních druhů z okolních států. Do budoucna je plánováno vytvoření tzv. systému včasného varování - alarmu, který upozorní na výskyt rizikového druhu v blízkosti hranic ČR. Na základě předem definovaných GPS souřadnic bude možné spustit varování při detekci výskytu nebezpečného ŠO v tzv. ochranném perimetru - pásmu za hranicemi ČR, kde budou výskyty sledovány se zvýšenou pozorností. Tento systém umožní rychlejší reakci kontrolních orgánů, a tím přispěje k efektivnější ochraně zemědělství, lesnictví i domácích ekosystémů. Spolupráce s mezinárodními databázemi, jako je GBIF, navíc zajistí, že ČR bude mít k dispozici aktuální globální data o šíření invazních druhů.

Takto nastavený systém zvýší mezinárodní spolupráci, zlepší předvídání rizik a posílí ochranu biodiverzity a přírodních zdrojů na území ČR.

Závěr

Centrální databáze invahub.cz představuje významný krok směrem k efektivnímu, koordinovanému a modernímu sledování výskytu nepůvodních a invazních škodlivých organizmů na území ČR. Její síla spočívá nejen v propojení více datových zdrojů, ale především ve schopnosti zpracovávat, filtrovat a vizualizovat data tak, aby byla užitečná pro odborníky, veřejnost i rozhodovací orgány.

Díky zapojení principů občanské vědy, spolupráci s odbornými skupinami a využití aktuálních technologií se zvyšuje nejen informovanost veřejnosti, ale i kvalita a množství dat dostupných pro monitoring a prevenci. Včasná detekce rizikových druhů a přehled o jejich šíření nejen v ČR, ale i v příhraničních oblastech, umožní lépe reagovat na potenciální hrozby pro přírodu, zemědělství i zdraví obyvatel.

Do budoucna bude zásadní pokračovat v rozvoji technického zázemí, rozšiřovat spolupráci s dalšími institucemi a využívat mezinárodní datové platformy. Jen tak může invahub.cz naplno využít svůj potenciál jako klíčový nástroj v boji proti biologickým invazím.

Výzkum probíhá v rámci řešení institucionální podpory CARC financované MZe RO023.